Pendant ce temps, au centre Jefferson, Zack se trouve devant le conseil scolaire pour défendre sa thèse. Brennan essaie de l'aider puisqu'elle est elle-même membre du conseil. Mais Booth entre pour emmener Brennan sur la scène de la crucifiction. Tous deux arrivent pour examiner la victime . Ses tripes ont été répandues et ce n'est pas une coincidence si l'hôtel au dessus duquel ils sont est utilisé pour héberger des témoins. Ce meurtre était un avertissement. Brennan remarque quelque chose coincé dans la trachée de la victime.
Au laboratoire, Cam, Hodgins, et Zack examinent le corps. Dans la trachée, Cam retire une boulette de papier sur laquelle est écrit : " Mon nom est Garrett Delaney." Elle retire aussi une pièce commémorative de Christophe Columb. Dans le bureau de Brennan, Russ, le frère de Temperance arrivé entre temps, explique que leur père lui a téléphoné et lui a dit qu'ils étaient tous les deux en danger. Il ajoute que dernièrement il a eu le sentiment d'être suivi. Brennan ne croit pas à tout cela, mais elle arrive à convaincre Russ de rester chez elle pour la nuit. Booth arrive avec une information : la victime qu'ils ont trouvée était un ancien agent du FBI. Ils partent inspecter son appartement.
Arrivés là-bas, ils trouvent une pièce fermée à clé et quand Booth force la porte, ils découvrent un mur entier recouvert de photos de surveillance de Russ, le frère de Brennan.
Brennan et Booth montrent les photos à Russ. Booth explique que ces clichés prouvent que Delaney avait l'intention de le tuer. Les photos sont prises de différents angles à partir desquels il pouvait abattre Russ.
Dans son bureau, Angela examine la note trouvée dans la gorge de Delaney. Au dos de la note, il est écrit que Marvin Beckett est innocent ; c'est un activiste pour les droits civiques dans les années 60, qui a été condamné à la prison à vie en 1978 pour le supposé meurtre de l'agent du FBI Augustus Harper. Angela agrandit la note et distingue "Aug... Harp...” signé en bas. Elle croise les références des noms avec les dossiers d'affaires déjà existantes et trouve une possible conspiration étouffée.
Hodgins donne cette information à Booth et explique que dans l'Ohio des années 60, il y avait un groupe d'agents du FBI et de la police locale corrompus. Ils ont commencé à prendre de l'argent des braqueurs de banque qu'ils étaient censés arrêter. Un agent a voulu quitter l'affaire, alors ils l'ont tué et accusé Marvin Beckett.
Brennan et Booth vont rendre visite à la femme d'Augustus Harper et elle leur dit qu'il rassemblait des information sur les flics corrompus avant de mourir. Il a entreposé ce qu'il a trouvé dans un coffre de la banque "Ohio First Savings and Loan" à Dayton, en Ohio. Cela touche Brennan car c'est la même banque que ses parents ont braquée le lendemain de la mort d'Augustus Harper.
Dans le bureau de Zack, celui-ci dit à Angela que le conseil semblait s'inquiéter de son apparence, notamment lors des procès. Elle lui conseille d'envisager de changer de look.
A l'appartement de Brennan, Russ évoque le fait que sa fille a des problèmes aux poumons. Booth arrive avec un dossier sur Gus Harper, leur explique que Harper surveillait Garrett Delaney et il leur montre le nom de code qu'ils utilisaient pour les braqueurs qu'ils traquaient. Brennan remarquent que tous les codes sont des explorateurs, dont Christophe Colomb, et comme tous les braqueurs de banque maintenant morts, ils en concluent que l'homme qui a brutalement tué Delaney était le père de Brennan.
Russ rejette le faute sur Brennan car, à l'origine, leur père disait d'arrêter de le chercher et Brennan ne l'a pas écouté, donc maintenant des gens se font tuer. Booth rejoint le procureur Caroline Julian au dîner pour voir si elle peut les assister sur l'affaire. Elle sait que cela peut briser sa carrière, mais elle leur suggère d'exhumer Gus Harper pour voir si Brennan confirme qu'il a été tué comme le FBI prétend que Marvin Beckett l'a tué.
Au labo, Brennan et Booth sont rejoints par Russ et un ami d'enfance de leur père, le Père Toby Coulter. Celui-ci a un message de la part de leur père : "Laissez tomber". Booth a réussi à avoir l'autorisation pour exhumer le corps de Gus Harper et Brennan et les fouines l'examinent au labo. Aussitôt, Cam peut dire que la balle qui a atteint le corps ne correspond pas aux armes mentionnées dans le rapport du FBI.
Au dîner, Booth rejoint Russ et lui dit qu'il a reçu un appel de son officier de probation disant qu'il a quitté l'Etat sans préavis. Booth lui dit de faire attention mais un tir explose la fenêtre. Booth le met à terre. Ils s'en sortent sains et saufs.
Au FBI, ils découvrent que Marvin Beckett a été relâché après les conclusions trouvées par le centre Jefferson, mais ils se demandent toujours qui a essayé de tuer Russ. Ils sont interrompus par le grand partron de Booth, Robert Kirby. Booth le rejoint dans une salle à part où il l'interroge sur ses intentions. Kirby suspend Booth du FBI.
Au labo, ils décident que la seule façon pour Booth de retrouver son travail est de résoudre l'enquête. Zack leur montre une video qu'il a élaborée à partir du type de balle qui a tué Gus Harper. Booth sait que cette balle était fournie par l'armée aux snipers dans les années 1970. Brennan pense que son père gardait peut-ête cette preuve dans le coffre fort de la banque de l'Ohio. Ils vont alors rendre visite au Père Coulter.
Booth et Brennan poussent le Père Coulter dans ses retranchements, mais il ne leur dit rien.
Au laboratoire, Zack demande à Angela son aide pour qu'il soit pris au sérieux par le conseil du Jefferson. Le procureur Julian rejoint Brennan et Booth au labo et leur donne un dossier sur tous les snipers connus dans les années 1970. Sur cette liste se trouve le grand patron de Booth, Robert Kirby. Ils appellent Russ pour lui dire qui est le sniper, mais ils n'arrivent pas à le contacter. Brennan et Booth passent à l'appartement de Brennan pour le voir, mais quand ils arrivent ils trouvent une flaque de sang.
Avec un échantillon du sang trouvé dans l'appartement de Brennan, elle et Booth arrivent au labo et Cam détermine qu'il ne correspond pas au sang de Russ. Brennan part sans que Booth ne s'en rende compte.
Brennan demande au père Coulter s'il peut l'aider. Il lui répond que Russ est avec leur père. Pendant ce temps Booth obtient un tuyau sur le vrai Père Coulter. Apparement, il a 90 ans et vit dans un hôpital.
Brennan réalise que le Père Coulter est, en vérité, son père, Max Keenan. Celui-ci lui donne le journal de Gus Harper avec toutes les preuves pour arrêter le policier corrumpu. Brennan va pour le menotter car elle a tout compris, mais il arrive à la contrer et la menotte au banc. Russ arrive en voiture, Max le rejoint et ils partent. Booth arrive à temps mais les laisse partir. Brennan a encore perdu. Son père part une nouvelle fois.
Sur le toit de l'hôtel du début de l'enquête, Max Keenan crucifie l'agent du FBI Kirby, et l'immole par le feu. Dans le labo, les fouines s'émerveillent devant le nouveau Zack, qui se tient devant eux dans un costume soigné et les cheveux courts. Cam l'accepte comme un nouveau membre à part entière de l'équipe, le Doctor Zack Addy. Ils partent dîner pour fêter ça.
Au diner, Booth entaîne Brennan dehors. Il lui dit qu'il a été réintégré et que son père a commis un nouveau meurtre. Brennan ne sait plus quoi penser.